دانشکده بهداشت دانشگاه علوم پزشکی گناباد از سال ۱۳۸۷ با موافقت شورای عالی گسترش دانشگاه ها و موسسات آموزش عالی کشور با ارتقاء دانشکده علوم پزشکی گناباد به دانشگاه، به عنوان یکی از سه دانشکده مستقل این دانشگاه شناخته شد و از سال ۱۳۹۶ فعالیت خود را به صورت رسمی آغاز کرد. در حال حاضر تعداد کل پرسنل دانشکده بهداشت ۲۷ نفر می باشد. که شامل ۹ نفر کارمند و ۱۸ نفر عضو هیئت علمی هستند و در حال حاضر ۳۵۵ دانشجو در رشته های مختلف (دکتری تخصصی پژوهش محور بهداشت محیط، کارشناسی ارشد آموزش بهداشت و ارتقاء سلامت، کارشناسی ارشد مهندسی بهداشت محیط، کارشناسی پیوسته و ناپیوسته بهداشت عمومی، کارشناسی مهندسی بهداشت محیط و کارشناسی مهندسی بهداشت حرفه ای و ایمنی کار) در این دانشکده تحصیل میکنند.